W Instytucie Technicznym Wojsk Lotniczych od szeregu lat istnieje system badań i certyfikacji o zasadach postępowania i zarządzania wypracowanych na podstawie własnych procedur, norm i wymagań wojskowych dotyczących przeprowadzania badań na zgodność w zakresie wojskowych statków powietrznych, nawierzchni lotniskowych oraz sprzętu lotniczego. W ramach dostosowania trybu prowadzenia prac badawczo-rozwojowych do międzynarodowych wymagań jakościowych ITWL wdrożył w 2001 roku system zarządzania jakością.

Obecnie ITWL posiada następujące certyfikaty:

• Certyfikaty Systemu Zarządzania Jakością
• PN-EN ISO 9001:2009 (nr. certyfikatu 50/S/2010) naukowo-badawcze wspomaganie eksploatacji lotniczej techniki wojskowej oraz szkolenie z zakresu techniki lotniczej.
• AQAP-2110:2009 (nr. certyfikatu 50/A/2010) naukowo-badawcze wspomaganie eksploatacji lotniczej techniki wojskowej oraz szkolenie z zakresu techniki lotniczej
• Koncesja nr B-404/2003 wykonywanie działalności gospodarczej w zakresie wytwarzania i obrotu bronią i amunicją, wyrobami oraz technologią o przeznaczeniu wojskowym lub policyjnym.
• Certyfikat Systemu Zarządzania Nr W-45/3/2009 naukowo - badawcze wspomaganie eksploatacji lotniczej techniki wojskowej z zachowaniem kryteriów Wewnętrznego Systemu Kontroli

• Certyfikaty akredytacji laboratoriów badawczych i wzorcujących spełniających wymogi PN-EN ISO/IEC 17025 :
• AB 098 - Laboratorium Zakładu Materiałów Pędnych i Smarów
  - zakres akredytacji
• AB 133 - Laboratorium Narażeń Mechanicznych i Klimatycznych
  - zakres akredytacji
• AB 134 - Laboratorium Pomiarów Ciśnienia
  - zakres akredytacji
• AP 004 - Laboratorium Pomiarów Ciśnienia
  - zakres akredytacji
• AB 137 - Laboratorium Badania Stanu Technicznego Wirnikowych Maszyn Przepływowych
  - zakres akredytacji
• AB 138 - Laboratorium Diagnostyki Systemów Tribologicznych
  - zakres akredytacji
• AB 430 - Laboratorium Badań Wytrzymałościowych Materiałów
  - zakres akredytacji
• AB 431 - Laboratorium Materiałowych Badań Konstrukcji Lotniczych
  - zakres akredytacji
• Certyfikat akredytacji jednostki certyfikującej wyroby spelniającej wymogami normy PN-EN 45011:2000
• AC 021 - Jednostka Certyfikująca Wyroby
  - zakres akredytacji
• Certyfikaty Akredytacji OiB:
• 5/MON/2009 - Jednostka Certyfikująca Wyroby
• 7/MON/2009 - Laboratorium Materiałowych Badań Konstrukcji Lotniczych
• 8/MON/2009 - Laboratorium Implementacji i Interoperacyjności Systemów LINK
• 13/MON/2009 - Laboratorium Pomiarów Ciśnienia
• 15/MON/2008 - Laboratorium Badania Stanu Technicznego Wirnikowych Maszyn Przepływowych
• 16/MON/2008 - Laboratorium Diagnostyki Systemów Tribologicznych
• 17/MON/2008 - Laboratorium Narażeń Mechanicznych i Klimatycznych
• 18/MON/2008 - Laboratorium Zakładu Materiałów Pędnych i Smarów